Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fv4P11370 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fv4P11370 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fv4P11370 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Fv4P11370 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fv4P11370 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fv4P11370 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fv4P11370 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fv4P11370 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Fv4P11370 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fv4P11370 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fv4P11370 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fv4P11370 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fv4P11370 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Fv4P11370 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fv4P11370 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fv4P11370 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fv4P11370 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fv4P11370 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fv4P11370 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fv4P11370 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fv4P11370 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fv4P11370 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fv4P11370 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Fv4P11370 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fv4P11370 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fv4P11370 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fv4P11370 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fv4P11370 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fv4P11370 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Fv4P11370 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fv4P11370 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fv4P11370 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Fv4P11370 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fv4P11370 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fv4P11370 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fv4P11370 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fv4P11370 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fv4P11370 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fv4P11370 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fv4P11370 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fv4P11370 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fv4P11370 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fv4P11370 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fv4P11370 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fv4P11370 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fv4P11370 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fv4P11370 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fv4P11370 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fv4P11370 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fv4P11370 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fv4P11370 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fv4P11370 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fv4P11370 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fv4P11370 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fv4P11370 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fv4P11370 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fv4P11370 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fv4P11370 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fv4P11370 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fv4P11370 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fv4P11370 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fv4P11370 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fv4P11370 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fv4P11370 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Fv4P11370 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fv4P11370 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fv4P11370 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fv4P11370 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fv4P11370 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fv4P11370 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fv4P11370 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fv4P11370 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fv4P11370 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fv4P11370 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fv4P11370 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fv4P11370 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fv4P11370 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fv4P11370 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fv4P11370 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fv4P11370 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fv4P11370 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fv4P11370 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fv4P11370 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fv4P11370 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fv4P11370 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fv4P11370 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fv4P11370 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fv4P11370 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fv4P11370 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fv4P11370 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Fv4P11370 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fv4P11370 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fv4P11370 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fv4P11370 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fv4P11370 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fv4P11370 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fv4P11370 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Fv4P11370 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fv4P11370 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms