Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Igsf6P0C6B7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Igsf6P0C6B7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Igsf6P0C6B7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Igsf6P0C6B7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Igsf6P0C6B7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Igsf6P0C6B7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 213.8 ms