Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt1P04104 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt1P04104 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt1P04104 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt1P04104 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt1P04104 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt1P04104 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt1P04104 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt1P04104 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt1P04104 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt1P04104 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt1P04104 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt1P04104 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt1P04104 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt1P04104 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt1P04104 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Krt1P04104 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt1P04104 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt1P04104 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt1P04104 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt1P04104 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt1P04104 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt1P04104 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt1P04104 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt1P04104 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt1P04104 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krt1P04104 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Krt1P04104 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt1P04104 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt1P04104 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Krt1P04104 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt1P04104 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt1P04104 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt1P04104 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt1P04104 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt1P04104 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Krt1P04104 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt1P04104 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt1P04104 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt1P04104 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt1P04104 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt1P04104 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt1P04104 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt1P04104 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt1P04104 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt1P04104 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt1P04104 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt1P04104 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt1P04104 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt1P04104 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt1P04104 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt1P04104 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt1P04104 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt1P04104 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt1P04104 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt1P04104 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt1P04104 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt1P04104 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt1P04104 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt1P04104 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt1P04104 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt1P04104 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt1P04104 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt1P04104 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt1P04104 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt1P04104 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt1P04104 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt1P04104 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt1P04104 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt1P04104 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt1P04104 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krt1P04104 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Krt1P04104 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krt1P04104 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krt1P04104 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt1P04104 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt1P04104 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt1P04104 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt1P04104 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt1P04104 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt1P04104 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt1P04104 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt1P04104 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt1P04104 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt1P04104 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt1P04104 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt1P04104 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt1P04104 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt1P04104 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt1P04104 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt1P04104 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt1P04104 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt1P04104 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt1P04104 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt1P04104 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt1P04104 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krt1P04104 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt1P04104 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt1P04104 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Krt1P04104 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms