Protein–RNA interactions for Protein: P01789

Ig heavy chain V region M603, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01789 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01789 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01789 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01789 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01789 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01789 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01789 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01789 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01789 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01789 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01789 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01789 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01789 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01789 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01789 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01789 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01789 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P01789 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01789 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01789 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01789 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01789 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01789 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01789 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01789 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01789 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01789 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01789 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01789 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01789 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01789 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01789 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01789 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01789 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01789 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01789 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01789 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01789 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01789 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01789 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01789 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01789 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01789 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01789 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01789 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01789 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01789 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01789 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01789 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01789 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01789 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01789 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01789 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01789 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01789 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01789 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01789 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01789 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01789 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01789 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01789 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01789 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01789 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01789 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01789 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01789 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01789 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01789 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01789 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01789 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01789 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01789 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01789 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01789 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01789 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01789 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01789 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01789 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01789 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01789 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01789 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01789 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01789 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01789 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01789 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01789 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01789 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01789 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01789 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01789 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01789 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01789 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01789 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01789 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01789 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01789 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01789 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01789 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01789 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01789 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms