Protein–RNA interactions for Protein: P01659

Ig kappa chain V-III region TEPC 124, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01659 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01659 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01659 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
P01659 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01659 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01659 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01659 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01659 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01659 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01659 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01659 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
P01659 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
P01659 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P01659 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01659 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01659 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01659 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01659 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01659 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01659 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P01659 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01659 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01659 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01659 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01659 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01659 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01659 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01659 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01659 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01659 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01659 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01659 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01659 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01659 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01659 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01659 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01659 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01659 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01659 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01659 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01659 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01659 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01659 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01659 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01659 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01659 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01659 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01659 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01659 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01659 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01659 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01659 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01659 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01659 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01659 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01659 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01659 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01659 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01659 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01659 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01659 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01659 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01659 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01659 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01659 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01659 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P01659 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01659 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01659 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01659 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01659 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01659 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01659 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01659 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P01659 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
P01659 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
P01659 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
P01659 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01659 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01659 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01659 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01659 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
P01659 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01659 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01659 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P01659 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01659 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01659 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01659 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01659 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01659 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01659 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
P01659 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01659 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01659 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01659 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01659 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01659 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P01659 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P01659 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms