Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccl20O89093 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccl20O89093 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccl20O89093 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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