Protein–RNA interactions for Protein: O88888

Apba3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba3O88888 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apba3O88888 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apba3O88888 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apba3O88888 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Apba3O88888 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apba3O88888 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apba3O88888 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apba3O88888 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apba3O88888 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apba3O88888 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apba3O88888 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apba3O88888 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apba3O88888 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apba3O88888 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apba3O88888 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apba3O88888 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Apba3O88888 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apba3O88888 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Apba3O88888 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Apba3O88888 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apba3O88888 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apba3O88888 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apba3O88888 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apba3O88888 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apba3O88888 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Apba3O88888 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apba3O88888 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Apba3O88888 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Apba3O88888 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apba3O88888 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apba3O88888 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apba3O88888 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apba3O88888 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apba3O88888 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apba3O88888 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apba3O88888 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apba3O88888 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apba3O88888 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apba3O88888 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apba3O88888 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apba3O88888 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apba3O88888 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apba3O88888 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apba3O88888 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apba3O88888 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Apba3O88888 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apba3O88888 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apba3O88888 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apba3O88888 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apba3O88888 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apba3O88888 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apba3O88888 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apba3O88888 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apba3O88888 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apba3O88888 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Apba3O88888 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Apba3O88888 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Apba3O88888 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apba3O88888 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apba3O88888 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Apba3O88888 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Apba3O88888 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apba3O88888 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apba3O88888 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apba3O88888 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apba3O88888 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apba3O88888 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Apba3O88888 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apba3O88888 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apba3O88888 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apba3O88888 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apba3O88888 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apba3O88888 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Apba3O88888 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apba3O88888 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apba3O88888 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Apba3O88888 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apba3O88888 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apba3O88888 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apba3O88888 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apba3O88888 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apba3O88888 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apba3O88888 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apba3O88888 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apba3O88888 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apba3O88888 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apba3O88888 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apba3O88888 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apba3O88888 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apba3O88888 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apba3O88888 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apba3O88888 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apba3O88888 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apba3O88888 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apba3O88888 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apba3O88888 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apba3O88888 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apba3O88888 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apba3O88888 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apba3O88888 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms