Protein–RNA interactions for Protein: O88351

Ikbkb, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IkbkbO88351 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IkbkbO88351 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IkbkbO88351 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IkbkbO88351 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IkbkbO88351 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IkbkbO88351 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IkbkbO88351 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IkbkbO88351 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IkbkbO88351 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IkbkbO88351 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IkbkbO88351 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IkbkbO88351 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IkbkbO88351 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IkbkbO88351 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IkbkbO88351 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IkbkbO88351 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IkbkbO88351 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IkbkbO88351 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IkbkbO88351 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IkbkbO88351 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IkbkbO88351 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IkbkbO88351 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IkbkbO88351 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IkbkbO88351 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IkbkbO88351 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IkbkbO88351 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
IkbkbO88351 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IkbkbO88351 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IkbkbO88351 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IkbkbO88351 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IkbkbO88351 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IkbkbO88351 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IkbkbO88351 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IkbkbO88351 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IkbkbO88351 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IkbkbO88351 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IkbkbO88351 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IkbkbO88351 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IkbkbO88351 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IkbkbO88351 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IkbkbO88351 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IkbkbO88351 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IkbkbO88351 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
IkbkbO88351 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IkbkbO88351 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IkbkbO88351 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IkbkbO88351 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IkbkbO88351 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IkbkbO88351 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IkbkbO88351 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IkbkbO88351 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IkbkbO88351 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IkbkbO88351 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IkbkbO88351 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IkbkbO88351 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IkbkbO88351 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IkbkbO88351 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IkbkbO88351 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IkbkbO88351 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IkbkbO88351 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IkbkbO88351 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IkbkbO88351 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IkbkbO88351 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IkbkbO88351 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IkbkbO88351 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IkbkbO88351 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IkbkbO88351 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IkbkbO88351 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IkbkbO88351 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IkbkbO88351 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IkbkbO88351 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IkbkbO88351 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IkbkbO88351 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IkbkbO88351 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IkbkbO88351 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IkbkbO88351 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IkbkbO88351 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IkbkbO88351 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IkbkbO88351 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IkbkbO88351 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IkbkbO88351 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IkbkbO88351 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IkbkbO88351 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IkbkbO88351 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IkbkbO88351 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IkbkbO88351 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IkbkbO88351 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IkbkbO88351 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IkbkbO88351 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IkbkbO88351 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IkbkbO88351 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IkbkbO88351 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IkbkbO88351 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IkbkbO88351 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IkbkbO88351 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IkbkbO88351 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IkbkbO88351 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IkbkbO88351 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IkbkbO88351 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IkbkbO88351 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms