Protein–RNA interactions for Protein: O70583

Mid1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1O70583 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mid1O70583 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mid1O70583 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mid1O70583 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mid1O70583 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mid1O70583 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mid1O70583 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mid1O70583 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mid1O70583 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mid1O70583 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mid1O70583 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mid1O70583 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Mid1O70583 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mid1O70583 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mid1O70583 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mid1O70583 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mid1O70583 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mid1O70583 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mid1O70583 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mid1O70583 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mid1O70583 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mid1O70583 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mid1O70583 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mid1O70583 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mid1O70583 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mid1O70583 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mid1O70583 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mid1O70583 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mid1O70583 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mid1O70583 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mid1O70583 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mid1O70583 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mid1O70583 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mid1O70583 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mid1O70583 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mid1O70583 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mid1O70583 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mid1O70583 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mid1O70583 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mid1O70583 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mid1O70583 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mid1O70583 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mid1O70583 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mid1O70583 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mid1O70583 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mid1O70583 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mid1O70583 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mid1O70583 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mid1O70583 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mid1O70583 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Mid1O70583 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mid1O70583 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Mid1O70583 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Mid1O70583 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Mid1O70583 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mid1O70583 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mid1O70583 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Mid1O70583 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mid1O70583 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mid1O70583 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mid1O70583 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mid1O70583 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mid1O70583 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mid1O70583 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mid1O70583 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mid1O70583 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Mid1O70583 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mid1O70583 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mid1O70583 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mid1O70583 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mid1O70583 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mid1O70583 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mid1O70583 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mid1O70583 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mid1O70583 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mid1O70583 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mid1O70583 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mid1O70583 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mid1O70583 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mid1O70583 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Mid1O70583 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Mid1O70583 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mid1O70583 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mid1O70583 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Mid1O70583 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mid1O70583 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mid1O70583 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mid1O70583 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mid1O70583 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mid1O70583 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mid1O70583 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mid1O70583 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mid1O70583 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mid1O70583 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mid1O70583 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Mid1O70583 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mid1O70583 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mid1O70583 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mid1O70583 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mid1O70583 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms