Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xirp1O70373 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xirp1O70373 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xirp1O70373 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xirp1O70373 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Xirp1O70373 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xirp1O70373 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xirp1O70373 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xirp1O70373 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xirp1O70373 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Xirp1O70373 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Xirp1O70373 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Xirp1O70373 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Xirp1O70373 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Xirp1O70373 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Xirp1O70373 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Xirp1O70373 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Xirp1O70373 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Xirp1O70373 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Xirp1O70373 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Xirp1O70373 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Xirp1O70373 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Xirp1O70373 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Xirp1O70373 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Xirp1O70373 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Xirp1O70373 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Xirp1O70373 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xirp1O70373 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xirp1O70373 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xirp1O70373 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xirp1O70373 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xirp1O70373 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xirp1O70373 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xirp1O70373 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Xirp1O70373 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xirp1O70373 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xirp1O70373 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Xirp1O70373 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xirp1O70373 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xirp1O70373 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xirp1O70373 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Xirp1O70373 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xirp1O70373 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Xirp1O70373 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xirp1O70373 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xirp1O70373 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xirp1O70373 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Xirp1O70373 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xirp1O70373 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xirp1O70373 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Xirp1O70373 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xirp1O70373 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xirp1O70373 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Xirp1O70373 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Xirp1O70373 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Xirp1O70373 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Xirp1O70373 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Xirp1O70373 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Xirp1O70373 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Xirp1O70373 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Xirp1O70373 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Xirp1O70373 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Xirp1O70373 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xirp1O70373 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xirp1O70373 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xirp1O70373 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Xirp1O70373 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xirp1O70373 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms