Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nptx2O70340 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nptx2O70340 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nptx2O70340 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nptx2O70340 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nptx2O70340 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nptx2O70340 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nptx2O70340 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nptx2O70340 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nptx2O70340 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nptx2O70340 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nptx2O70340 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nptx2O70340 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nptx2O70340 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nptx2O70340 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nptx2O70340 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nptx2O70340 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nptx2O70340 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nptx2O70340 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nptx2O70340 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nptx2O70340 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nptx2O70340 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nptx2O70340 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nptx2O70340 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nptx2O70340 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nptx2O70340 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nptx2O70340 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nptx2O70340 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nptx2O70340 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nptx2O70340 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nptx2O70340 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nptx2O70340 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nptx2O70340 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nptx2O70340 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nptx2O70340 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nptx2O70340 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nptx2O70340 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nptx2O70340 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nptx2O70340 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nptx2O70340 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nptx2O70340 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nptx2O70340 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nptx2O70340 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nptx2O70340 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nptx2O70340 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nptx2O70340 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nptx2O70340 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nptx2O70340 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nptx2O70340 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nptx2O70340 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nptx2O70340 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nptx2O70340 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nptx2O70340 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nptx2O70340 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nptx2O70340 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nptx2O70340 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nptx2O70340 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nptx2O70340 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nptx2O70340 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nptx2O70340 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nptx2O70340 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nptx2O70340 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nptx2O70340 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nptx2O70340 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nptx2O70340 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nptx2O70340 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nptx2O70340 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms