Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chrna4O70174 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Chrna4O70174 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms