Protein–RNA interactions for Protein: O54799

Nmbr, Neuromedin-B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbrO54799 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NmbrO54799 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NmbrO54799 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NmbrO54799 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NmbrO54799 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NmbrO54799 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NmbrO54799 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NmbrO54799 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NmbrO54799 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NmbrO54799 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NmbrO54799 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NmbrO54799 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NmbrO54799 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NmbrO54799 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NmbrO54799 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NmbrO54799 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NmbrO54799 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NmbrO54799 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NmbrO54799 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
NmbrO54799 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NmbrO54799 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NmbrO54799 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NmbrO54799 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NmbrO54799 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NmbrO54799 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NmbrO54799 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NmbrO54799 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NmbrO54799 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NmbrO54799 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NmbrO54799 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NmbrO54799 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NmbrO54799 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NmbrO54799 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NmbrO54799 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NmbrO54799 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NmbrO54799 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NmbrO54799 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NmbrO54799 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NmbrO54799 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NmbrO54799 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NmbrO54799 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NmbrO54799 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NmbrO54799 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NmbrO54799 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NmbrO54799 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NmbrO54799 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NmbrO54799 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NmbrO54799 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NmbrO54799 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NmbrO54799 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NmbrO54799 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NmbrO54799 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NmbrO54799 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NmbrO54799 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NmbrO54799 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NmbrO54799 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NmbrO54799 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NmbrO54799 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NmbrO54799 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NmbrO54799 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NmbrO54799 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NmbrO54799 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NmbrO54799 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NmbrO54799 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NmbrO54799 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NmbrO54799 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NmbrO54799 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NmbrO54799 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NmbrO54799 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NmbrO54799 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NmbrO54799 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NmbrO54799 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NmbrO54799 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NmbrO54799 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NmbrO54799 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NmbrO54799 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NmbrO54799 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NmbrO54799 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NmbrO54799 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NmbrO54799 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NmbrO54799 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NmbrO54799 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NmbrO54799 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NmbrO54799 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NmbrO54799 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NmbrO54799 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NmbrO54799 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NmbrO54799 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NmbrO54799 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NmbrO54799 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NmbrO54799 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NmbrO54799 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NmbrO54799 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NmbrO54799 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NmbrO54799 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NmbrO54799 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NmbrO54799 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NmbrO54799 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NmbrO54799 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NmbrO54799 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms