Protein–RNA interactions for Protein: O35902

Dsg3, Desmoglein-3, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg3O35902 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dsg3O35902 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dsg3O35902 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Dsg3O35902 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dsg3O35902 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dsg3O35902 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dsg3O35902 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dsg3O35902 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dsg3O35902 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dsg3O35902 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Dsg3O35902 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dsg3O35902 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Dsg3O35902 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dsg3O35902 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dsg3O35902 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dsg3O35902 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dsg3O35902 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dsg3O35902 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dsg3O35902 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dsg3O35902 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dsg3O35902 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dsg3O35902 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsg3O35902 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsg3O35902 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsg3O35902 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsg3O35902 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsg3O35902 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsg3O35902 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsg3O35902 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsg3O35902 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsg3O35902 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsg3O35902 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dsg3O35902 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dsg3O35902 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dsg3O35902 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dsg3O35902 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dsg3O35902 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dsg3O35902 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Dsg3O35902 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dsg3O35902 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Dsg3O35902 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dsg3O35902 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dsg3O35902 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dsg3O35902 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms