Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stag2O35638 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Stag2O35638 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stag2O35638 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stag2O35638 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stag2O35638 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stag2O35638 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stag2O35638 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stag2O35638 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stag2O35638 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stag2O35638 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stag2O35638 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Stag2O35638 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stag2O35638 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stag2O35638 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stag2O35638 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stag2O35638 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stag2O35638 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stag2O35638 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stag2O35638 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stag2O35638 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stag2O35638 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stag2O35638 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stag2O35638 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stag2O35638 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stag2O35638 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Stag2O35638 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stag2O35638 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stag2O35638 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stag2O35638 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stag2O35638 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stag2O35638 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stag2O35638 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stag2O35638 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stag2O35638 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stag2O35638 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stag2O35638 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stag2O35638 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stag2O35638 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stag2O35638 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stag2O35638 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stag2O35638 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stag2O35638 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stag2O35638 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stag2O35638 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stag2O35638 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stag2O35638 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Stag2O35638 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stag2O35638 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stag2O35638 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stag2O35638 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Stag2O35638 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stag2O35638 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stag2O35638 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Stag2O35638 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms