Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stx1aO35526 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stx1aO35526 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stx1aO35526 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stx1aO35526 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stx1aO35526 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stx1aO35526 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stx1aO35526 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx1aO35526 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx1aO35526 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx1aO35526 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx1aO35526 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx1aO35526 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stx1aO35526 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stx1aO35526 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stx1aO35526 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stx1aO35526 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stx1aO35526 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stx1aO35526 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stx1aO35526 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stx1aO35526 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Stx1aO35526 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stx1aO35526 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stx1aO35526 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stx1aO35526 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stx1aO35526 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx1aO35526 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx1aO35526 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx1aO35526 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx1aO35526 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx1aO35526 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx1aO35526 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx1aO35526 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stx1aO35526 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stx1aO35526 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stx1aO35526 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stx1aO35526 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stx1aO35526 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stx1aO35526 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stx1aO35526 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stx1aO35526 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stx1aO35526 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stx1aO35526 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stx1aO35526 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stx1aO35526 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stx1aO35526 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stx1aO35526 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stx1aO35526 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stx1aO35526 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stx1aO35526 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stx1aO35526 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stx1aO35526 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stx1aO35526 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stx1aO35526 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stx1aO35526 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Stx1aO35526 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stx1aO35526 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stx1aO35526 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stx1aO35526 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stx1aO35526 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stx1aO35526 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stx1aO35526 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stx1aO35526 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stx1aO35526 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stx1aO35526 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stx1aO35526 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stx1aO35526 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stx1aO35526 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stx1aO35526 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stx1aO35526 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stx1aO35526 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stx1aO35526 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stx1aO35526 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stx1aO35526 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms