Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube3aO08759 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube3aO08759 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube3aO08759 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ube3aO08759 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ube3aO08759 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ube3aO08759 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ube3aO08759 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube3aO08759 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube3aO08759 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube3aO08759 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube3aO08759 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ube3aO08759 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ube3aO08759 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ube3aO08759 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ube3aO08759 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ube3aO08759 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ube3aO08759 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ube3aO08759 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ube3aO08759 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ube3aO08759 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ube3aO08759 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ube3aO08759 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ube3aO08759 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube3aO08759 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube3aO08759 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube3aO08759 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube3aO08759 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube3aO08759 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube3aO08759 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube3aO08759 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ube3aO08759 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube3aO08759 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube3aO08759 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube3aO08759 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube3aO08759 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube3aO08759 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube3aO08759 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube3aO08759 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube3aO08759 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube3aO08759 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube3aO08759 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube3aO08759 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube3aO08759 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ube3aO08759 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ube3aO08759 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ube3aO08759 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ube3aO08759 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ube3aO08759 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ube3aO08759 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube3aO08759 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube3aO08759 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube3aO08759 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube3aO08759 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube3aO08759 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube3aO08759 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ube3aO08759 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube3aO08759 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube3aO08759 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube3aO08759 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube3aO08759 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube3aO08759 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube3aO08759 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube3aO08759 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube3aO08759 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ube3aO08759 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ube3aO08759 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ube3aO08759 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ube3aO08759 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ube3aO08759 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ube3aO08759 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ube3aO08759 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube3aO08759 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube3aO08759 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube3aO08759 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube3aO08759 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube3aO08759 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube3aO08759 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ube3aO08759 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ube3aO08759 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ube3aO08759 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ube3aO08759 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ube3aO08759 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ube3aO08759 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ube3aO08759 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms