Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU0

Spin2f, Spindlin family, member 2F, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spin2fJ3QPU0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spin2fJ3QPU0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spin2fJ3QPU0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spin2fJ3QPU0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spin2fJ3QPU0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spin2fJ3QPU0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spin2fJ3QPU0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spin2fJ3QPU0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spin2fJ3QPU0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spin2fJ3QPU0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spin2fJ3QPU0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spin2fJ3QPU0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spin2fJ3QPU0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spin2fJ3QPU0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spin2fJ3QPU0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spin2fJ3QPU0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spin2fJ3QPU0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spin2fJ3QPU0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spin2fJ3QPU0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spin2fJ3QPU0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spin2fJ3QPU0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spin2fJ3QPU0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spin2fJ3QPU0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spin2fJ3QPU0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spin2fJ3QPU0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spin2fJ3QPU0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spin2fJ3QPU0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spin2fJ3QPU0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spin2fJ3QPU0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spin2fJ3QPU0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spin2fJ3QPU0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spin2fJ3QPU0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spin2fJ3QPU0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spin2fJ3QPU0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spin2fJ3QPU0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Spin2fJ3QPU0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spin2fJ3QPU0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spin2fJ3QPU0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spin2fJ3QPU0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spin2fJ3QPU0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spin2fJ3QPU0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spin2fJ3QPU0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spin2fJ3QPU0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spin2fJ3QPU0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spin2fJ3QPU0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spin2fJ3QPU0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spin2fJ3QPU0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spin2fJ3QPU0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms