Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 91 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smim22J3QP37 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Smim22J3QP37 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smim22J3QP37 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smim22J3QP37 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smim22J3QP37 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smim22J3QP37 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smim22J3QP37 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smim22J3QP37 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smim22J3QP37 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smim22J3QP37 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smim22J3QP37 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smim22J3QP37 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smim22J3QP37 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smim22J3QP37 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smim22J3QP37 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smim22J3QP37 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smim22J3QP37 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smim22J3QP37 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smim22J3QP37 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smim22J3QP37 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smim22J3QP37 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smim22J3QP37 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smim22J3QP37 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smim22J3QP37 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Smim22J3QP37 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Smim22J3QP37 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smim22J3QP37 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smim22J3QP37 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smim22J3QP37 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smim22J3QP37 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smim22J3QP37 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smim22J3QP37 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smim22J3QP37 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smim22J3QP37 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smim22J3QP37 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smim22J3QP37 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smim22J3QP37 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Smim22J3QP37 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smim22J3QP37 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Smim22J3QP37 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Smim22J3QP37 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smim22J3QP37 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smim22J3QP37 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smim22J3QP37 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smim22J3QP37 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smim22J3QP37 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smim22J3QP37 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms