Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chrna9G3X8Z7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chrna9G3X8Z7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chrna9G3X8Z7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chrna9G3X8Z7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chrna9G3X8Z7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chrna9G3X8Z7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chrna9G3X8Z7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chrna9G3X8Z7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chrna9G3X8Z7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Chrna9G3X8Z7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Chrna9G3X8Z7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chrna9G3X8Z7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Chrna9G3X8Z7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Chrna9G3X8Z7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chrna9G3X8Z7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chrna9G3X8Z7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chrna9G3X8Z7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chrna9G3X8Z7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chrna9G3X8Z7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chrna9G3X8Z7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chrna9G3X8Z7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chrna9G3X8Z7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chrna9G3X8Z7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Chrna9G3X8Z7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chrna9G3X8Z7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Chrna9G3X8Z7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chrna9G3X8Z7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chrna9G3X8Z7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chrna9G3X8Z7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chrna9G3X8Z7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chrna9G3X8Z7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chrna9G3X8Z7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chrna9G3X8Z7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chrna9G3X8Z7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chrna9G3X8Z7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chrna9G3X8Z7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chrna9G3X8Z7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chrna9G3X8Z7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chrna9G3X8Z7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chrna9G3X8Z7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chrna9G3X8Z7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Chrna9G3X8Z7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chrna9G3X8Z7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chrna9G3X8Z7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chrna9G3X8Z7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chrna9G3X8Z7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chrna9G3X8Z7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chrna9G3X8Z7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chrna9G3X8Z7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chrna9G3X8Z7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chrna9G3X8Z7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chrna9G3X8Z7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chrna9G3X8Z7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms