Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r39G3UWE6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r39G3UWE6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r39G3UWE6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r39G3UWE6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r39G3UWE6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r39G3UWE6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r39G3UWE6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r39G3UWE6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r39G3UWE6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r39G3UWE6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r39G3UWE6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r39G3UWE6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r39G3UWE6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r39G3UWE6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r39G3UWE6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r39G3UWE6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r39G3UWE6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r39G3UWE6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r39G3UWE6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r39G3UWE6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r39G3UWE6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r39G3UWE6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r39G3UWE6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r39G3UWE6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r39G3UWE6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r39G3UWE6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Vmn1r39G3UWE6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r39G3UWE6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r39G3UWE6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r39G3UWE6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r39G3UWE6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r39G3UWE6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r39G3UWE6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r39G3UWE6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r39G3UWE6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r39G3UWE6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r39G3UWE6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r39G3UWE6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r39G3UWE6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r39G3UWE6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r39G3UWE6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r39G3UWE6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r39G3UWE6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r39G3UWE6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r39G3UWE6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r39G3UWE6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r39G3UWE6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r39G3UWE6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r39G3UWE6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r39G3UWE6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r39G3UWE6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r39G3UWE6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r39G3UWE6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r39G3UWE6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r39G3UWE6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r39G3UWE6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r39G3UWE6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r39G3UWE6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r39G3UWE6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vmn1r39G3UWE6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vmn1r39G3UWE6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vmn1r39G3UWE6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r39G3UWE6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r39G3UWE6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r39G3UWE6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r39G3UWE6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r39G3UWE6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r39G3UWE6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r39G3UWE6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r39G3UWE6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r39G3UWE6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r39G3UWE6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r39G3UWE6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r39G3UWE6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r39G3UWE6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r39G3UWE6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r39G3UWE6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r39G3UWE6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r39G3UWE6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r39G3UWE6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r39G3UWE6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r39G3UWE6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r39G3UWE6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r39G3UWE6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r39G3UWE6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r39G3UWE6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r39G3UWE6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r39G3UWE6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r39G3UWE6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r39G3UWE6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r39G3UWE6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r39G3UWE6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r39G3UWE6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn1r39G3UWE6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn1r39G3UWE6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn1r39G3UWE6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn1r39G3UWE6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn1r39G3UWE6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn1r39G3UWE6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms