Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20538F6Z9R1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20538F6Z9R1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms