Protein–RNA interactions for Protein: F6VLK5

Gm10722, Predicted gene 10722, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10722F6VLK5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm10722F6VLK5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm10722F6VLK5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm10722F6VLK5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm10722F6VLK5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm10722F6VLK5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm10722F6VLK5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm10722F6VLK5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm10722F6VLK5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm10722F6VLK5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm10722F6VLK5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm10722F6VLK5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm10722F6VLK5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm10722F6VLK5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm10722F6VLK5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm10722F6VLK5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm10722F6VLK5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm10722F6VLK5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm10722F6VLK5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm10722F6VLK5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm10722F6VLK5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm10722F6VLK5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm10722F6VLK5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm10722F6VLK5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm10722F6VLK5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm10722F6VLK5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm10722F6VLK5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm10722F6VLK5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm10722F6VLK5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm10722F6VLK5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm10722F6VLK5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm10722F6VLK5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm10722F6VLK5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm10722F6VLK5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm10722F6VLK5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm10722F6VLK5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm10722F6VLK5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm10722F6VLK5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm10722F6VLK5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm10722F6VLK5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm10722F6VLK5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm10722F6VLK5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm10722F6VLK5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm10722F6VLK5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm10722F6VLK5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm10722F6VLK5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm10722F6VLK5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm10722F6VLK5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm10722F6VLK5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm10722F6VLK5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm10722F6VLK5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms