Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp31E9Q6Y8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp31E9Q6Y8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp31E9Q6Y8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp31E9Q6Y8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp31E9Q6Y8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp31E9Q6Y8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp31E9Q6Y8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp31E9Q6Y8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp31E9Q6Y8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp31E9Q6Y8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp31E9Q6Y8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp31E9Q6Y8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp31E9Q6Y8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp31E9Q6Y8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp31E9Q6Y8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp31E9Q6Y8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp31E9Q6Y8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp31E9Q6Y8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp31E9Q6Y8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp31E9Q6Y8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp31E9Q6Y8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp31E9Q6Y8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp31E9Q6Y8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp31E9Q6Y8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp31E9Q6Y8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp31E9Q6Y8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp31E9Q6Y8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp31E9Q6Y8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp31E9Q6Y8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp31E9Q6Y8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp31E9Q6Y8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp31E9Q6Y8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp31E9Q6Y8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp31E9Q6Y8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp31E9Q6Y8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp31E9Q6Y8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp31E9Q6Y8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp31E9Q6Y8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp31E9Q6Y8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp31E9Q6Y8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp31E9Q6Y8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp31E9Q6Y8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp31E9Q6Y8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp31E9Q6Y8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp31E9Q6Y8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp31E9Q6Y8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp31E9Q6Y8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp31E9Q6Y8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp31E9Q6Y8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp31E9Q6Y8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp31E9Q6Y8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp31E9Q6Y8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp31E9Q6Y8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp31E9Q6Y8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp31E9Q6Y8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp31E9Q6Y8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp31E9Q6Y8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp31E9Q6Y8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp31E9Q6Y8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp31E9Q6Y8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp31E9Q6Y8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp31E9Q6Y8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp31E9Q6Y8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp31E9Q6Y8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp31E9Q6Y8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp31E9Q6Y8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp31E9Q6Y8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp31E9Q6Y8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp31E9Q6Y8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp31E9Q6Y8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp31E9Q6Y8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp31E9Q6Y8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp31E9Q6Y8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp31E9Q6Y8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp31E9Q6Y8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp31E9Q6Y8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp31E9Q6Y8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp31E9Q6Y8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp31E9Q6Y8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp31E9Q6Y8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp31E9Q6Y8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp31E9Q6Y8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp31E9Q6Y8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp31E9Q6Y8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp31E9Q6Y8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp31E9Q6Y8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp31E9Q6Y8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp31E9Q6Y8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp31E9Q6Y8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp31E9Q6Y8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp31E9Q6Y8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp31E9Q6Y8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp31E9Q6Y8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp31E9Q6Y8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp31E9Q6Y8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp31E9Q6Y8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp31E9Q6Y8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp31E9Q6Y8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp31E9Q6Y8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms