Protein–RNA interactions for Protein: E9Q658

Pate1, Prostate and testis-expressed 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate1E9Q658 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pate1E9Q658 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pate1E9Q658 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pate1E9Q658 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pate1E9Q658 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pate1E9Q658 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pate1E9Q658 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pate1E9Q658 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pate1E9Q658 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pate1E9Q658 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pate1E9Q658 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pate1E9Q658 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pate1E9Q658 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pate1E9Q658 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pate1E9Q658 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pate1E9Q658 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pate1E9Q658 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pate1E9Q658 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pate1E9Q658 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pate1E9Q658 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pate1E9Q658 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pate1E9Q658 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pate1E9Q658 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pate1E9Q658 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pate1E9Q658 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pate1E9Q658 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pate1E9Q658 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pate1E9Q658 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pate1E9Q658 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pate1E9Q658 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pate1E9Q658 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pate1E9Q658 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pate1E9Q658 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pate1E9Q658 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pate1E9Q658 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pate1E9Q658 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pate1E9Q658 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pate1E9Q658 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pate1E9Q658 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pate1E9Q658 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pate1E9Q658 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pate1E9Q658 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pate1E9Q658 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pate1E9Q658 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pate1E9Q658 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pate1E9Q658 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pate1E9Q658 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pate1E9Q658 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pate1E9Q658 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pate1E9Q658 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pate1E9Q658 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pate1E9Q658 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pate1E9Q658 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pate1E9Q658 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pate1E9Q658 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pate1E9Q658 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pate1E9Q658 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pate1E9Q658 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms