Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ3

Rpl3l, Ribosomal protein L3-like, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3lE9PWZ3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl3lE9PWZ3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl3lE9PWZ3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl3lE9PWZ3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl3lE9PWZ3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl3lE9PWZ3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl3lE9PWZ3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl3lE9PWZ3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl3lE9PWZ3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl3lE9PWZ3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl3lE9PWZ3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl3lE9PWZ3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl3lE9PWZ3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl3lE9PWZ3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl3lE9PWZ3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl3lE9PWZ3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl3lE9PWZ3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl3lE9PWZ3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl3lE9PWZ3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl3lE9PWZ3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl3lE9PWZ3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl3lE9PWZ3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl3lE9PWZ3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl3lE9PWZ3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl3lE9PWZ3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl3lE9PWZ3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl3lE9PWZ3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl3lE9PWZ3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl3lE9PWZ3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl3lE9PWZ3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl3lE9PWZ3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl3lE9PWZ3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl3lE9PWZ3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl3lE9PWZ3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl3lE9PWZ3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl3lE9PWZ3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl3lE9PWZ3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl3lE9PWZ3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl3lE9PWZ3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl3lE9PWZ3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl3lE9PWZ3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl3lE9PWZ3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl3lE9PWZ3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl3lE9PWZ3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl3lE9PWZ3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl3lE9PWZ3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl3lE9PWZ3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl3lE9PWZ3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl3lE9PWZ3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl3lE9PWZ3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl3lE9PWZ3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl3lE9PWZ3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl3lE9PWZ3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl3lE9PWZ3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms