Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0P8

Tmem200b, Transmembrane protein 200B, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200bD3Z0P8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem200bD3Z0P8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem200bD3Z0P8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem200bD3Z0P8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem200bD3Z0P8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem200bD3Z0P8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem200bD3Z0P8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem200bD3Z0P8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem200bD3Z0P8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem200bD3Z0P8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem200bD3Z0P8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem200bD3Z0P8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem200bD3Z0P8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem200bD3Z0P8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem200bD3Z0P8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem200bD3Z0P8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem200bD3Z0P8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem200bD3Z0P8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem200bD3Z0P8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem200bD3Z0P8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem200bD3Z0P8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem200bD3Z0P8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmem200bD3Z0P8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem200bD3Z0P8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms