Protein–RNA interactions for Protein: D3YXJ9

Cldn24, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn24D3YXJ9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn24D3YXJ9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn24D3YXJ9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn24D3YXJ9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn24D3YXJ9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn24D3YXJ9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn24D3YXJ9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn24D3YXJ9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn24D3YXJ9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn24D3YXJ9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn24D3YXJ9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cldn24D3YXJ9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn24D3YXJ9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cldn24D3YXJ9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms