Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Syce3B5KM66 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syce3B5KM66 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Syce3B5KM66 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syce3B5KM66 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syce3B5KM66 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Syce3B5KM66 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syce3B5KM66 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syce3B5KM66 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syce3B5KM66 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syce3B5KM66 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syce3B5KM66 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Syce3B5KM66 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syce3B5KM66 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syce3B5KM66 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syce3B5KM66 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syce3B5KM66 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syce3B5KM66 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syce3B5KM66 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syce3B5KM66 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syce3B5KM66 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syce3B5KM66 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syce3B5KM66 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syce3B5KM66 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syce3B5KM66 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syce3B5KM66 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syce3B5KM66 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syce3B5KM66 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syce3B5KM66 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Syce3B5KM66 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syce3B5KM66 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syce3B5KM66 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Syce3B5KM66 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Syce3B5KM66 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Syce3B5KM66 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Syce3B5KM66 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syce3B5KM66 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syce3B5KM66 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syce3B5KM66 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syce3B5KM66 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Syce3B5KM66 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syce3B5KM66 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syce3B5KM66 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syce3B5KM66 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syce3B5KM66 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syce3B5KM66 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Syce3B5KM66 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Syce3B5KM66 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Syce3B5KM66 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Syce3B5KM66 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syce3B5KM66 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syce3B5KM66 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syce3B5KM66 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syce3B5KM66 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syce3B5KM66 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syce3B5KM66 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syce3B5KM66 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syce3B5KM66 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syce3B5KM66 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syce3B5KM66 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syce3B5KM66 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syce3B5KM66 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Syce3B5KM66 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Syce3B5KM66 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Syce3B5KM66 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Syce3B5KM66 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Syce3B5KM66 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Syce3B5KM66 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Syce3B5KM66 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syce3B5KM66 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syce3B5KM66 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syce3B5KM66 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syce3B5KM66 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syce3B5KM66 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Syce3B5KM66 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syce3B5KM66 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Syce3B5KM66 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syce3B5KM66 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syce3B5KM66 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Syce3B5KM66 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syce3B5KM66 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Syce3B5KM66 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syce3B5KM66 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Syce3B5KM66 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Syce3B5KM66 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syce3B5KM66 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syce3B5KM66 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syce3B5KM66 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syce3B5KM66 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syce3B5KM66 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syce3B5KM66 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Syce3B5KM66 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syce3B5KM66 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syce3B5KM66 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syce3B5KM66 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syce3B5KM66 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Syce3B5KM66 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Syce3B5KM66 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Syce3B5KM66 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Syce3B5KM66 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms