Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Siah3B2RWG3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Siah3B2RWG3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Siah3B2RWG3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Siah3B2RWG3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Siah3B2RWG3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Siah3B2RWG3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Siah3B2RWG3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Siah3B2RWG3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Siah3B2RWG3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Siah3B2RWG3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Siah3B2RWG3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Siah3B2RWG3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Siah3B2RWG3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Siah3B2RWG3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Siah3B2RWG3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Siah3B2RWG3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Siah3B2RWG3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Siah3B2RWG3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Siah3B2RWG3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Siah3B2RWG3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Siah3B2RWG3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Siah3B2RWG3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Siah3B2RWG3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Siah3B2RWG3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Siah3B2RWG3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Siah3B2RWG3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Siah3B2RWG3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Siah3B2RWG3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Siah3B2RWG3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Siah3B2RWG3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Siah3B2RWG3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Siah3B2RWG3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Siah3B2RWG3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Siah3B2RWG3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Siah3B2RWG3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Siah3B2RWG3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Siah3B2RWG3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Siah3B2RWG3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Siah3B2RWG3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Siah3B2RWG3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Siah3B2RWG3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Siah3B2RWG3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Siah3B2RWG3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Siah3B2RWG3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Siah3B2RWG3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Siah3B2RWG3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Siah3B2RWG3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Siah3B2RWG3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Siah3B2RWG3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Siah3B2RWG3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Siah3B2RWG3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Siah3B2RWG3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Siah3B2RWG3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms