Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB3

Gm438, MCG65768, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm438B1ASB3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm438B1ASB3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gm438B1ASB3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm438B1ASB3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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