Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pm20d2A3KG59 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pm20d2A3KG59 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pm20d2A3KG59 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms