Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2P7S8

Uncharacterized protein, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2P7S8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
A0A1W2P7S8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
A0A1W2P7S8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
A0A1W2P7S8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A1W2P7S8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A1W2P7S8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A1W2P7S8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A1W2P7S8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A1W2P7S8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A1W2P7S8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A1W2P7S8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A1W2P7S8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A1W2P7S8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A1W2P7S8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A1W2P7S8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A1W2P7S8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A1W2P7S8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A1W2P7S8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A1W2P7S8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A1W2P7S8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A1W2P7S8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A1W2P7S8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A1W2P7S8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A1W2P7S8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A1W2P7S8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A1W2P7S8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A1W2P7S8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A1W2P7S8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A1W2P7S8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A1W2P7S8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A1W2P7S8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A1W2P7S8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A1W2P7S8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A1W2P7S8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A1W2P7S8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
A0A1W2P7S8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A1W2P7S8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A1W2P7S8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A1W2P7S8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A1W2P7S8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A1W2P7S8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A1W2P7S8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A1W2P7S8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A1W2P7S8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A1W2P7S8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A1W2P7S8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A1W2P7S8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A1W2P7S8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A1W2P7S8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A1W2P7S8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A1W2P7S8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A1W2P7S8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A1W2P7S8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A1W2P7S8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A1W2P7S8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A1W2P7S8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A1W2P7S8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A1W2P7S8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A1W2P7S8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A1W2P7S8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A1W2P7S8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A1W2P7S8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A1W2P7S8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A1W2P7S8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A1W2P7S8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A1W2P7S8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A1W2P7S8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A1W2P7S8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A1W2P7S8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A1W2P7S8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
A0A1W2P7S8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1W2P7S8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1W2P7S8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1W2P7S8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1W2P7S8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1W2P7S8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A1W2P7S8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A1W2P7S8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A1W2P7S8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A1W2P7S8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A1W2P7S8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A1W2P7S8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A1W2P7S8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A1W2P7S8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A1W2P7S8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A1W2P7S8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A1W2P7S8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A1W2P7S8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A1W2P7S8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A1W2P7S8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A1W2P7S8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A1W2P7S8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms