Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GRH6

Zscan4-ps3, Zinc finger and SCAN domain containing 4, pseudogene 3, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms