Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S6

Cldn10, Claudin-10, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn10Q9Z0S6 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Cldn10Q9Z0S6 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Cldn10Q9Z0S6 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Cldn10Q9Z0S6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Gm26848-201ENSMUST00000181052 2467 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cldn10Q9Z0S6 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn10Q9Z0S6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms