Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPHK2Q9NRA0 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPHK2Q9NRA0 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms