Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ap3b2Q9JME5 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms