Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESC8

Aff4, AF4/FMR2 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff4Q9ESC8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Aff4Q9ESC8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms