Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Pfn4Q9D6I3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Pfn4Q9D6I3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Pfn4Q9D6I3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Pfn4Q9D6I3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Pfn4Q9D6I3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Pfn4Q9D6I3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms