Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Pabpc6Q9D4E6 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Pabpc6Q9D4E6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pabpc6Q9D4E6 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pabpc6Q9D4E6 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pabpc6Q9D4E6 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pabpc6Q9D4E6 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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