Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cabp4Q8VHC5 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cabp4Q8VHC5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cabp4Q8VHC5 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cabp4Q8VHC5 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cabp4Q8VHC5 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cabp4Q8VHC5 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cabp4Q8VHC5 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cabp4Q8VHC5 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cabp4Q8VHC5 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cabp4Q8VHC5 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cabp4Q8VHC5 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cabp4Q8VHC5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cabp4Q8VHC5 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cabp4Q8VHC5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cabp4Q8VHC5 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cabp4Q8VHC5 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cabp4Q8VHC5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cabp4Q8VHC5 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cabp4Q8VHC5 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cabp4Q8VHC5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cabp4Q8VHC5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cabp4Q8VHC5 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cabp4Q8VHC5 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cabp4Q8VHC5 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cabp4Q8VHC5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms