Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccp110Q7TSH4 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms