Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
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PcolceQ61398 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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PcolceQ61398 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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PcolceQ61398 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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PcolceQ61398 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
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PcolceQ61398 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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PcolceQ61398 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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PcolceQ61398 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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PcolceQ61398 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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PcolceQ61398 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms