Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chrna5Q2MKA5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chrna5Q2MKA5 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms