Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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PTPN13Q12923 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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PTPN13Q12923 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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PTPN13Q12923 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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PTPN13Q12923 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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PTPN13Q12923 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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PTPN13Q12923 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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PTPN13Q12923 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPN13Q12923 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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