Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BPTFQ12830 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms