Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms