Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
VcpQ01853 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
VcpQ01853 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VcpQ01853 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
VcpQ01853 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms