Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx3P81067 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx3P81067 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx3P81067 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx3P81067 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx3P81067 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx3P81067 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx3P81067 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Irx3P81067 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms