Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps33bP59016 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms